摘要
Reactome 知识库（https://reactome.org）是款可免费访问、专家人工注释、开源开放的资源库，以分子层面的细节描述人类生物学特征。涵盖正常生理过程及疾病机制，包括遗传变异和药物作用的影响。Reactome 的内容持续扩充与修订，目前已通过自动化工作流监控撤回文献，以保障数据完整性。为满足日益增长的用户需求，Reactome 推出了基于 Angular 框架的全新界面，具有更强的可访问性、模块化架构及层级化可视化工具：用于全局通路概览的 ReacFoam、便于直观导航的增强型高层级示意图（EHLD）、经优化的实体级视图（ELV）—— 后者整合了化学结构、动画蛋白模型，并新增 “对比模式” 以比较正常与疾病状态。新增分析工具支持多组学数据整合与可定制化可视化功能。近期创新亮点包括支持自然语言交互的 React-to-me 聊天机器人、社区驱动的教程资源及开源 Figma 图标库。Reactome 的可持续性及对 FAIR 数据原则的合规性已通过核心信任印章（CoreTrustSeal）认证，并被认定为全球核心生物数据资源及 ELIXIR 核心数据资源，进一步巩固了其作为可信全球知识库的地位。
引言
表1Reactome 数据汇总
2023 年 9 月 86 版 vs 2025 年 9 月 94 版
通路可视化工具层级体系
图1所有人类通路的 ReacFoam 概览（ReacFoam 视图）
网页左侧面板展示完整的事件层级结构，右侧面板以沃罗诺伊图（Voronoi diagram）呈现，按颜色分组关联通路，按多边形大小展示各通路的相对内容量。
图2代谢超级通路的 EHLD 视图
左侧事件层级展开显示代谢亚通路，EHLD 以教科书式概览的形式呈现这些亚通路。
图3ELV 中单个反应的视图（R-HSA-3095889——MMACHC 介导钴胺素脱烷基化反应）
放大后，反应中的蛋白质和化学物质参与者图标会显示结构细节；右侧图例为实体类型和事件类型提供说明。
分析功能
图4分析结果综合截图
分析结果可通过多种视图可视化：
（A）事件层级、
（B）ReacFoam 视图、
（C）EHLD 视图、
（D）ELV 视图、
（E）结果表格。
所示结果来自 “代谢组学” 示例的定性富集分析。面板（B）取自概览视图，面板（C）取自 R-HSA-1643685 通路，面板（A）、（D）、（E）取自 R-HSA-3359467 通路。
对比模式
图5MMACHC 蛋白突变（R-HSA-3359474）破坏正常钴胺素代谢的２个反应（R-HSA-3095889 和 R-HSA-3149519）
上方面板展示正常反应；向左拖动垂直边框栏可查看突变导致的反应异常细节。
详细结果
思维导图（mindmap 脑图）
2023-2025 年核心数据更新
参考
Nucleic Acids Res. 2025 Nov 18:gkaf1223. doi: 10.1093/nar/gkaf1223. The Reactome Knowledgebase 2026
注：AI辅助创作，如有错误欢迎指出。内容仅供参考，不构成任何建议。
